Систематическое изучение и коллекционирование памятников древности началось в ХVII в., в период Токугава. К этому времени относятся первые попытки систематического изучения курганов-"кофун".
Первым европейцем, который в 20-х гг. ХIX в. познакомил Запад с японскими древностями в своем труде "Япония", был Филипп Франц фон Зибольд. Однако внедрение современных научных методов археологических исследований началось только в конце ХIX в. и было связано с именами американца Э. Морса и англичанина В. Гоулэнда. Именно Э. Морс в 1879 г. впервые употребил термин "веревочная керамика", японский аналог которого - Дзёмон - стал обозначать целый период древней истории.
По району Токио - Яёй-мати, где в 1884 г. были при раскопках обнаружены сосуды, принадлежавшие эпохе, пришедшей на смену Дзёмон, стал называться другой период истории Японии - Яёй.
Формирование современной археологической школы в Японии произошло к началу XX в. В 1896 г. в стране организуется Археологическое общество. В 1909 г. в университете Киото был прочитан первый курс по археологии.
Сегодня археологические исследования проводятся с применением самых современных технологий. Каждый год работы ведутся на 9-10 тысячах объектов, ежегодно выпускается несколько тысяч монографий по археологической тематике. В Японии зарегистрировано около 5 тысяч профессиональных археологов. Раскопками занимаются университеты, местные власти, любители.
Работа археологов вызывает интерес не только у профессионалов. Сообщения о новых находках археологов выносятся на первые полосы газет, их обсуждают в качестве важнейших событий на телевидении.
